福建省水产研究所成立于1957年，现已发展成为专业比较齐全、技术力量较为雄厚、设备较为完善的综合性海洋与渔业研究机构。

研究所科研与技术开发工作面向全省，主要研究领域：海洋生物技术、海水养殖新品种的苗种繁育和养殖技术，水产养殖病害监测和防治，海洋渔业资源调查、开发利用和保护管理研究，渔业环境调查、监测和评价，渔业工程技术研究开发，海洋港口工程勘察与可行性调查研究，水产品保鲜加工和综合利用、水产品质量检测与监督管理等方面。上述各专业可提供咨询服务、项目论证和业务培训。

现有在职职工130人，其中高级研究人员46人、中级研究人员40人，享受国务院政府特殊津贴5人，省“百千万人才工程”人选5人，厦门市拔尖人才1人。研究所设8个业务研究室、三站二中心、一场一基地、5个职能科室；研究所占地面积10.22万平方米：实验楼、办公楼等建筑面积1.9万平方米，养殖池塘面积4.2万平方米。总资产3000余万元，各类科研仪器设备1000余台（件），现馆藏专业图书3万余册，国内外专业期刊200余种，与福建省水产学会共同主办期刊《福建水产》，海洋生物标本室收集福建沿海海洋生物标本1000余种，被列为厦门市科普教育基地。

建所以来，共主持、参加并完成研究课题800余项，1978年至今已有180项研究成果通过省、部级技术鉴定，并有90多项次获得国家及省部级奖励。多数研究成果已在全省推广应用，形成生产力，为福建省海洋与渔业经济的发展做出了贡献。