北京市水产科学研究所成立于1958年，市属科研单位。1999年经国家科技部、农业部批准，在北京市水产科学研究所、北京市汇瀛水产良种开发中心基础上组建了国家淡水渔业工程技术研究中心北京中心，隶属于北京市水产总公司、北京市科学技术委员会。是科研、开发、营销一体化的科技经济实体。

　　"中心"本部设在北京市水产科学研究所，另有小汤山现代渔业高科技园区、延庆玉渡山冷水鱼基地、板桥温水鱼养殖基地、密云水产品综合加工厂，占地总面积77公顷，组成了以现代水产高新技术为先导的系统化工程基地。

　　"中心"科研和科技产业开发设施完备，有现代化仪器100余台件；水产高技术实验室、北京渔业信息中心等科研、信息、实验设备齐全；拥有3000m2办公、实验大楼，2000m2的科技培训中心；高标准敞水池塘45公顷；高密度冷水鱼养殖池3000m2；育种养殖温室2公顷；现代化日光温室8400m2；引进国外先进设备的鲟鱼工厂化养殖车间1000m2；综合国内外最新技术设计的海水鱼工厂化车间3000m2；有水温48.5～53℃的热水井5口。

　　"中心"主要从事生物技术研究；水产种质与良种选育；海、淡水名优鱼类繁育、养殖；工厂化养殖和健康养殖；冷水性鱼类高密度流水养殖；湖泊、水库增养殖；观赏鱼类和观赏水生植物养殖技术开发；水产养殖病害防治；生物制剂；水产动物营养与饲料；水产品加工与综合利用；渔业环保；渔业信息等水产高新技术研究和产业化开发。

　　"中心"设立了国家级北京水产名优良种场、中国观赏鱼研究会、北京水产学会、北京市水产科技中心、北京市淡水鱼养殖中心、水产中试基地、北京市技术创新与生产力促进中心渔业分中心。

"中心"在国家和北京市政府的支持和关怀下，将加速水产技术创新步伐，发展高科技，实现渔业产业化，立足北京，面向全国，走向世界。